Hikaru, Umi e Fuu sono tre quindicenni di Tokyo che frequentano l'ultimo anno delle scuole medie. Le tre ragazze sono molto amiche e una volta, sotto il ciliegio del giardino della loro scuola, si sono giurate di non separarsi mai, per nessuna ragione al mondo. Adesso, però, in vista della fine dell'anno, la situazione sembra andar contro i loro desideri: dopo il diploma, infatti, prenderanno strade diverse. Un giorno Hikaru, mentre si trova sotto il ciliegio, viene sconvolta da una scossa di terremoto: in quel momento dall'albero cade un buffo folletto bianco simile ad un coniglio, Mokona. Nello stesso tempo strani mostri cominciano ad apparire a Tokyo con lo scopo di distruggere la città. Le tre ragazze incontrano così Clef, che le aiuterà a diventare Cavalieri Magici per difendere la Terra contro gli invasori di Cefiro.